الأهداف الإستراتيجية المرتبطة ببناء القدرات الأساسية للوزارة:

1. إدخال وتطبيق نظم وأدوات الإدارة الحديثة بالوزارة مثل : إدارة الجودة الشاملة ، التخطيط الإستراتيجي ، مجالات الشئون القانونية ،ادارة الخدمات العامة ، موازنات البرامج والأداء،
   إدارة الأزمات ، نظم دعم القرار، ونظم الرصد والتحليل المستمر للمتغيرات المحلية والخارجية المؤثرة على عمل الوزارة .
2. إعادة هيكلة الأوضاع التنظيمية بالوزارة في إطار رؤيتها المستقبلية وأهدافها الإستراتيجية ، مع مراعاة وضوح الأهداف والاختصاصات المحددة للقطاعات الرئيسة والإدارات الفنية،
   والتجانس التنظيمي داخل القطاعات ، والمرونة التنظيمية .
3. إعادة هيكلة وبناء النظم المرتبطة بقوة العمل بالوزارة ومنها : نظام توصيف الوظائف ، نظام التدريب ، نظام الأجور والحوافز ونظام التقييم المرتبط بمعايير موضوعية لقياس الأداء.
4. تحويل وزارة المالية إلى الإدارة الإليكترونية الكاملة من خلال خطط متواصلة للميكنة المكتبية والتشبيك Networking بقطاعات وأنشطة الوزارة المختلفة داخليا، والتشبيك المؤسسي
   مع الجهات المعنية داخل وخارج الدولة .
5. بناء واستكمال قواعد البيانات ونظم المعلومات النوعية الأساسية لدعم أنشطة الوزارة مثل: قواعد البيانات المالية والاقتصادية ، نظام معلومات الموارد البشرية ، نظـم المعلـومات
   الضريبـيـة، نظم المعلومات الجغرافية ، نظم الحفظ والأرشفة والاسترجاع الإليكـترونيـة ، نظـام الـسـجـل العـام ، النظم المالية المتكاملة ، نظام المعلومات القانونية ، وغيرها.